MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Sinorhizobium fredii USDA 257 plasmid pUSDA257

Total Repeats: 24

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018197	TGC	2	6	24	29	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_018197	CCG	2	6	43	48	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_018197	CAGG	2	8	54	61	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4	NC_018197	GTTG	2	8	1403	1410	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018197	CG	3	6	1466	1471	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6	NC_018197	TAG	2	6	1546	1551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018197	CAC	2	6	1575	1580	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_018197	TGG	2	6	1589	1594	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018197	TGG	2	6	1601	1606	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018197	TCG	2	6	1612	1617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_018197	CGGT	2	8	1649	1656	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
12	NC_018197	CGT	2	6	1668	1673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_018197	TGT	2	6	1677	1682	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018197	GAC	2	6	1693	1698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_018197	TGG	2	6	1811	1816	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018197	CAT	2	6	1838	1843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_018197	AG	3	6	1988	1993	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018197	GAAG	2	8	2006	2013	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018197	CA	3	6	2910	2915	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_018197	AGC	2	6	2923	2928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_018197	CGC	2	6	2933	2938	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_018197	AG	3	6	2972	2977	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018197	CGT	2	6	2986	2991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_018197	TGGA	2	8	3009	3016	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.